草薙柴舟是草薙京的父亲，上代草薙流古武术的传承者。柴舟让出了传承者的位置给京，自己则外出进行武者修行。
拳皇94大赛中，柴舟想协助草薙京对付卢卡尔，单独挑战卢卡尔，被卢卡尔打成重伤。等到获得优胜的京、大门、红丸赶到时，濒死的柴舟交代京一定要打败卢卡尔。京等人将卢卡尔打败后，不甘心失败的卢卡尔启动了自爆系统，趁乱逃走时将柴舟的尸体一起带走。
拳皇95大赛前夕，卢卡尔和麦卓、薇思一起用大蛇之力将柴舟复活后洗脑，指使柴舟和京交战。柴舟被京等人打败后，解除了洗脑，交代京几句话后就昏迷了。最终卢卡尔因体内的大蛇之力暴走而灰飞烟灭，京等人逃离了现场，柴舟也以自己的方式逃了出来，之后站在岩石上的柴舟若有所思的说：京将面对更大的挑战.......
拳皇2001后，草薙京和他的老队友二阶堂红丸和大门五郎半路丢下了矢吹真吾，这时柴舟出现收矢吹真吾为徒，实际上他是想证明自己比京更擅长教授弟子（将柴舟和卢卡尔打败不是固定的背景故事，没有固定对手和固定胜负，是由玩家自行选择角色的发展）。